南通市妇幼保健院（南通市儿童医院）成立于1982年，是一所集医疗、保健、科研、教学于一体的三级甲等妇幼保健院。医院于1983年4月1日正式开诊，2013年整体迁建至南通市新城区，毗邻南通市行政中心。
南通市妇幼保健院的综合实力雄厚，专科特色明显。目前医院有江苏省妇幼保健重点学科3个，分别是产科学、新生儿医学、儿童保健科;市级临床医学中心建设单位1个，产前诊断中心;市级重点学科2个，分别是生殖医学中心、新生儿科;市级临床重点专科12个，分别是产科、病理产科、微创妇科、新生儿科、生殖健康与不孕不育、乳腺科、医学检验科、医学遗传学实验室、儿童**科、儿童心理卫生科、产科护理、新生儿科护理;市级医学创新团队4个，儿童**、中西医结合乳腺疾病、小儿外科、妇产科护理。
该院是国家住院医师规范化培训协同基地、江苏省新生儿疾病筛查南通分中心、江苏省产前诊断筛查南通分中心、江苏省新生儿危急重症救治中心、南通市孕产妇和新生儿危急重症救治中心、南通市母婴专科护士培训基地、南通市助产专科护士培训基地、南通市儿童危重症专科护士培训基地。
南通市妇幼保健院生殖医学中心创建于2000年，在医院领导的大力支持下，在国内知名的临床生殖内分泌和辅助生育技术专家的指导下，中心工作人员发扬团队精神，依托医院实力试管婴儿，在临床、教学、科研方面形成了独特的技术体系。在苏中、苏北地区率先开展了人工授精技术，第一、第二代试管婴儿及其衍生技术。中心连续18年被确定为南通市重点学科、南通市重点专科，是获得江苏省卫生厅批准的准许开展辅助生殖技术的单位。
试管婴儿和辅助生殖技术是该院生殖中心的核心部分，这里有宽敞而舒适的试管婴儿手术室和现代化的胚胎实验室。配备了经验丰富的医护团队及技术精湛的胚胎专家，实施包括夫精人工授精（IUI-AIH）和各项试管婴儿的技术，包括常规体外受精-胚胎移植技术（IVF-ET）、卵胞浆内单精子显微注射技术（ICSI）、卵子、精子及胚胎冷冻、睾丸和附睾穿刺、卵子捐赠、胚胎囊胚培养、胚胎植入前遗传学诊断和筛查（PGD/PGS）等，各个试管婴儿技术项目均可在这里完成。
经过近二十年的发展，该院生殖中心不仅以特色的专科服务服务于本地区的患者，同时在邻近地区也享有良好的声誉。
